22世纪初，有巨龙携神石从天外而降，地球只剩下最后一片绿洲。来自外星的神秘海伦军队为私人寻找神石而降临地球，他们自称是神，他们将要占领人类最后的家园。面对外敌入侵，地球人利用神石唤醒体内沉睡已久的远古基因，于是，星武战士诞生。电影部分强大的星武战士为率领人类共御外敌，组建星武联盟，最终击退“大魔王”。三百年后，一个神秘少年来院到星珠城。而他的出现，才是一切的开始。